【3月28日，船队抵达马萨瓦岛，船员在此举行了基督教弥撒，在岛上的山丘上竖起了十字架，正式宣布该岛和整个菲律宾群岛属于西班牙。】
【4月3日，船队来到宿务岛，来到这里麦哲伦发现他的马来西亚仆人能够和当地土著交流，交流之后才知道自己来到了亚洲。】
【麦哲伦船队主动卷入了宿务岛两支部落的冲突，最后麦哲伦被当地土著杀死。船队的27名船员被杀死。由于人太少，他们无法驾驶三艘船，最后烧掉了康赛普塞号，只剩下特力尼达号和维多利亚号继续航行。】
【由于麦哲伦被杀，群龙无首，船队在菲律宾苏禄海一带到处瞎转，一方面寻找香料群岛，一方面从事海盗活动维持生计。】
【一直到10月底，船队找到了一名香料岛当地人，终于在11月6日到达香料群岛。】
【11月8日，船员们用廉价的小巧的工艺品，在当地换取了大量的肉桂，豆蔻和丁香等香料。直至于将两艘大船装满。】
【然而，在准备返航的前一天，船队旗舰号特立尼达号漏水，不得已只得停船维修。】
【1521年12月21日，60名船员乘坐维多利亚号率先启航，计划通过印度洋航线返回西班牙。】
【1522年4月26日，修好的特立尼达号离开蒂多雷岛，准备横渡太平洋原路返回西班牙，结果强劲的东南季风将他们吹向了北方，到达千岛群岛附近。】
【长期的风暴和坏血病的折磨，特立尼达号决定返航，结果被葡萄牙军队抓获，查封了他们船上所有的香料，所有船员被关入了大牢，后来仅有四人活了下来。】
【1522年5 月6日，维多利亚号绕过了好望角，横渡印度洋期间，25名船员因为坏血病死亡。】
【1522年7月9日，维多利亚号船员终于扛不住了，驶入了葡萄牙人控制的福德角群岛停靠补新鲜食物，被葡萄牙人发现，结果3名船员被捕，剩余的22名船员继续北上，中途4名船员身亡。】
【1522年9月6日，千疮百孔的维多利亚号回到了西班牙。】